271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0811 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
351 aa  729    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  79.7 
 
 
336 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  79.7 
 
 
336 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  77.81 
 
 
339 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  75.75 
 
 
335 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  51.81 
 
 
340 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  50.3 
 
 
340 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  49.55 
 
 
341 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  49.55 
 
 
341 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  44.16 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  47.62 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  46.33 
 
 
341 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  47.94 
 
 
351 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  50.32 
 
 
340 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 
341 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  48.57 
 
 
341 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  46.45 
 
 
341 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  48.72 
 
 
341 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  46.62 
 
 
351 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 
349 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  43.04 
 
 
345 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  43.67 
 
 
346 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  43.67 
 
 
358 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.35 
 
 
358 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.35 
 
 
358 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  43.35 
 
 
356 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  37.94 
 
 
342 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 
339 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 
339 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
343 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 
343 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 
344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  32.05 
 
 
343 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 
344 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  30.49 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
342 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.24 
 
 
341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.24 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 
340 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  35.83 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.1 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
344 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 
342 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.44 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  29.73 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 
347 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
342 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
340 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  29.57 
 
 
367 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
342 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  30.19 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
335 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.71 
 
 
338 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
333 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  27.15 
 
 
331 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 
379 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
322 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 
325 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  28.88 
 
 
364 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.6 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  27.27 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.6 
 
 
341 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  26.61 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  27.71 
 
 
344 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
442 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
440 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.96 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  26.84 
 
 
344 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  26.41 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  26.41 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  26.41 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
378 aa  89.4  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  23.75 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  26.41 
 
 
344 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 
330 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.41 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  26.84 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  26.84 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>