275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5719 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  91.18 
 
 
363 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  71.08 
 
 
347 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  71.38 
 
 
366 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  70.77 
 
 
347 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  54.65 
 
 
343 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  53.53 
 
 
346 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  52.23 
 
 
359 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  55.95 
 
 
352 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  51.17 
 
 
362 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  57.19 
 
 
352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  53.75 
 
 
343 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  51.6 
 
 
350 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  51.93 
 
 
348 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  50.45 
 
 
342 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  52.94 
 
 
342 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.94 
 
 
342 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  53.13 
 
 
408 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  50.85 
 
 
367 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  53.39 
 
 
343 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  51.63 
 
 
348 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.84 
 
 
374 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  53.13 
 
 
348 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  51.14 
 
 
374 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.84 
 
 
374 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.84 
 
 
348 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.81 
 
 
349 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.63 
 
 
342 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  52.5 
 
 
349 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  51.04 
 
 
348 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  51.04 
 
 
348 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  51.04 
 
 
348 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  53.44 
 
 
348 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  53.44 
 
 
348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  52.5 
 
 
346 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  51.63 
 
 
348 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  52.19 
 
 
346 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  52.5 
 
 
348 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  51.75 
 
 
344 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  50.74 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  51.25 
 
 
343 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  47.86 
 
 
342 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  51.25 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  50.29 
 
 
344 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  50.29 
 
 
344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  48.54 
 
 
348 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  47.51 
 
 
343 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
344 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  49.26 
 
 
344 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  48.54 
 
 
348 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  48.26 
 
 
347 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  48.1 
 
 
342 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  49.54 
 
 
345 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
344 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  51.24 
 
 
347 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.59 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  48.21 
 
 
344 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  47.32 
 
 
344 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  46.15 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  45.17 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 
346 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 
351 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.31 
 
 
366 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.31 
 
 
366 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  37.24 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  39.25 
 
 
348 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.68 
 
 
358 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  36.21 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.86 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
356 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  38.75 
 
 
357 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 
360 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.43 
 
 
370 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.15 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.61 
 
 
358 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.93 
 
 
359 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  36.14 
 
 
357 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
361 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  34.57 
 
 
360 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 
351 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.81 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
341 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2988  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.65 
 
 
368 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 
368 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1773  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.63 
 
 
377 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2544  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.09 
 
 
370 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66454  normal  0.363997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1267  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.94 
 
 
371 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.704416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
341 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 
341 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.63 
 
 
341 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  33.02 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  32.72 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>