212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2544 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2544  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 370 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66454  normal  0.363997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3858  extracellular solute-binding protein  60.06 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.29 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.06 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  32.45 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  31.73 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.7 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.7 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  33.65 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.6 
 
 		 348 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.29 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.39 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.39 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.05 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  31.75 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  33.97 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  33.97 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  31.45 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.97 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  31.03 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  32.27 
 
 		 344 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  34.45 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  31.21 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  31.3 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 336 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 341 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  30.43 
 
 		 348 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  30.43 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  31.65 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  30.84 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  29.78 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.6 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 		 352 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.15 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2372  twin-arginine translocation pathway signal  30.55 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  29.05 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  27.86 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  29.33 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4360  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00124658  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.67 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3190  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.07 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  28.86 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  28.74 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 351 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.88 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  28.74 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  30.27 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>