249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0446 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
352 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  63.36 
 
 
352 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  41.3 
 
 
336 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  41.3 
 
 
336 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 
341 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 
341 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  38.1 
 
 
341 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
341 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  37.74 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 
341 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  40.44 
 
 
336 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
350 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  37.96 
 
 
341 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  36.61 
 
 
346 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
350 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.42 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  35.71 
 
 
357 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  35.78 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  35.47 
 
 
367 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  36.22 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.23 
 
 
370 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  35.14 
 
 
352 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
350 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
352 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
345 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
348 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
348 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
348 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.88 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.88 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.88 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.88 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.88 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.88 
 
 
408 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
342 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
344 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0567  extracellular solute-binding protein family 1  34.28 
 
 
366 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.149111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 
342 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
344 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
345 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
360 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  36.28 
 
 
346 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  32.85 
 
 
344 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.62 
 
 
344 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
344 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.24 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.17 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  34.25 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  31.81 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  31.71 
 
 
344 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 
362 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.25 
 
 
348 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 
343 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  34.45 
 
 
346 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  34.15 
 
 
351 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  35.98 
 
 
346 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
351 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  33.03 
 
 
359 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  33.03 
 
 
348 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 
343 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  33.03 
 
 
348 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  34.01 
 
 
363 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  34.62 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.22 
 
 
366 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 
349 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.22 
 
 
366 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.94 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.45 
 
 
358 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.45 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
361 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 
347 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  33.73 
 
 
363 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.44 
 
 
357 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  32.72 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  35.17 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  34.43 
 
 
357 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
353 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
343 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  32.71 
 
 
349 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
344 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.31 
 
 
344 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0755  ABC transporter, binding protein  33.97 
 
 
371 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491874  normal  0.244729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>