297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4108 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
349 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  73.93 
 
 
348 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  73.93 
 
 
348 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  75.96 
 
 
347 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  67.34 
 
 
346 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  68.33 
 
 
338 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  55.46 
 
 
350 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  52.48 
 
 
346 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  48.28 
 
 
359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  49.4 
 
 
362 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 
343 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  49.28 
 
 
342 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  48.97 
 
 
342 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  48.82 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 
343 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  46.9 
 
 
342 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  49.71 
 
 
343 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  46.97 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  45.24 
 
 
363 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  48.31 
 
 
348 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  48.31 
 
 
348 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  48.6 
 
 
352 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  48.92 
 
 
342 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  48.92 
 
 
342 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  47.79 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  47.37 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  46.99 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  48.62 
 
 
342 aa  311  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  47.16 
 
 
344 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  45.17 
 
 
366 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  46.04 
 
 
345 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  48.15 
 
 
349 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.85 
 
 
408 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  45.85 
 
 
374 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 
344 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 
348 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  46.78 
 
 
344 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 
344 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  44.12 
 
 
363 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.15 
 
 
349 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  47.34 
 
 
344 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 
347 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  45.85 
 
 
348 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.56 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.56 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  45.17 
 
 
347 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  46.61 
 
 
367 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.56 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  47.2 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.21 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  46.85 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 
348 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 
348 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  45.99 
 
 
346 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  45.68 
 
 
346 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  45.79 
 
 
351 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  46.3 
 
 
346 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  44.86 
 
 
351 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  46.3 
 
 
347 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.55 
 
 
348 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  43.44 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  43.44 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  42.9 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  44.44 
 
 
358 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.51 
 
 
370 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
345 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  39.94 
 
 
354 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 
360 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.3 
 
 
356 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.5 
 
 
363 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.5 
 
 
358 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  40.12 
 
 
357 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  42.25 
 
 
357 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  39 
 
 
359 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  39.66 
 
 
356 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  38.14 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 
341 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
341 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  39.08 
 
 
341 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 
341 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 
341 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  37.64 
 
 
341 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  39.08 
 
 
336 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
353 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 
339 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  38.39 
 
 
341 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  37.85 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2988  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.7 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 
352 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  36.21 
 
 
336 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  35.95 
 
 
361 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  34.69 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>