More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0643 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  95.69 
 
 		 348 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  95.63 
 
 		 408 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  89.08 
 
 		 348 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  95.36 
 
 		 374 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  95.63 
 
 		 374 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  100 
 
 		 367 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  89.08 
 
 		 348 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  95.36 
 
 		 374 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  95.98 
 
 		 348 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  89.08 
 
 		 348 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  87.93 
 
 		 348 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  89.08 
 
 		 348 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  87.64 
 
 		 348 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  92.26 
 
 		 349 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  91.64 
 
 		 349 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  88.66 
 
 		 350 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  92.52 
 
 		 348 aa  617  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  87.07 
 
 		 348 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  83.62 
 
 		 346 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  83.33 
 
 		 346 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  87.31 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  69.47 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  65.09 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  65.88 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  63.93 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  65.33 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  65.33 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  63.39 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  64.72 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  65.42 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  65.17 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  62.93 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  62.68 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  62.68 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  62.68 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  63.12 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  63.91 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  62.39 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  64.4 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  56.64 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  56.02 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  56.64 
 
 		 344 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  55.49 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  55.27 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  57.5 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  54.71 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  53.98 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  54.82 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  50.85 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  51.81 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  51.81 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  51.51 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  51.64 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  53.25 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  50.6 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  49.7 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  49.4 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  49.1 
 
 		 348 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  48.25 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  49.22 
 
 		 351 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  46.91 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.66 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  43.8 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  43.8 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  42.94 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  40.75 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.69 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.34 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  42.48 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.21 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  40.62 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.93 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.28 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  41.36 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  34.01 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  38.15 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1267  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.34 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.704416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 		 336 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  36.53 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  36.92 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  35.17 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2988  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.85 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  35.47 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>