242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  97.44 
 
 		 352 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  65.85 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  62.97 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  61.4 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  62.72 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  63.87 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  61.99 
 
 		 343 aa  454  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  61.65 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  60.77 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  60.77 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  60.18 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  60.77 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  58.81 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  62.62 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  62.62 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  60.44 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  55.85 
 
 		 342 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  55.85 
 
 		 342 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  55.56 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  59.6 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  57.59 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  57.28 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  58.51 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  55.98 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  57.5 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  58.44 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  56.92 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  56.34 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  58.44 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  58.44 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  56.18 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  58.13 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  57.5 
 
 		 367 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  57.8 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  55.29 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  55.07 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  55.43 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  57.23 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  58.13 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  58.13 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  57.19 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  55.39 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.8 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  54.78 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  56.56 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  54.87 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  54.12 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  56.88 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  55.78 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  55.95 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  54.49 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  51.76 
 
 		 345 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  51.23 
 
 		 345 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  47.98 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  48.41 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  47.98 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  49.08 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  48.15 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  46.25 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  45.31 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  46.72 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  46.2 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  46.2 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.34 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  45.86 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.75 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.31 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.3 
 
 		 363 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  40.67 
 
 		 354 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.16 
 
 		 358 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  44.6 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  40.94 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  40.56 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  40 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  39.28 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 353 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 341 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1267  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.56 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.704416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  35.65 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  34.63 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  35.91 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  36.09 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  33.63 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  35.67 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2988  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.66 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  32.84 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>