283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2543 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 359 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  94.94 
 
 		 362 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  82.7 
 
 		 343 aa  594  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  82.11 
 
 		 343 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  76.4 
 
 		 342 aa  544  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  72.43 
 
 		 342 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  72.14 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  71.85 
 
 		 342 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  62.97 
 
 		 352 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  65.62 
 
 		 352 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  60.29 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  60.47 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  58.7 
 
 		 344 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  58.43 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  58.43 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  59 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  56.98 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  59.44 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  59.44 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  56.85 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  54.49 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  54.49 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  53.76 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  54.91 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  54.8 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  56.67 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  55.23 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  55.33 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  55.29 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  55.94 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.06 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  56.75 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  56.53 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  55.29 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  55.33 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  55 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.38 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  52.23 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  54.71 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  52.38 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  56.17 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.1 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  53.82 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  55.25 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  53.73 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  52.1 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  57.19 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  55.56 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  53.53 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  50.93 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  50.86 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  51.23 
 
 		 347 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  50.57 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  48.82 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  50.45 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  50.46 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  43.03 
 
 		 351 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  41.43 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  41.64 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 		 360 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.13 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.13 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  41.64 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  37.71 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  38.98 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 360 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.92 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.55 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.44 
 
 		 358 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.16 
 
 		 356 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  39.44 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  37.21 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.06 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  39.48 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 353 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  38.33 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  40 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  37.06 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  36.62 
 
 		 343 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  36.65 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.51 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  33.89 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  36.81 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>