272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4687 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 356 aa  729    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3858  extracellular solute-binding protein  49.84 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2544  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  46 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66454  normal  0.363997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  36.88 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  35.65 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2372  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  36.28 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  35.96 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3190  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.85 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  36.28 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  36.02 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.83 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  35.6 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  36.34 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  35.62 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.81 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  36.81 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  36.81 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.52 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.52 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.52 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  34.39 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  31.66 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  32.85 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.62 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  35.65 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  36.2 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.75 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.96 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  31.19 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.28 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  31.29 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0755  ABC transporter, binding protein  34.02 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491874  normal  0.244729 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  32.21 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  31.19 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  34.36 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  33.75 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  33.95 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  34.05 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.15 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.15 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3734  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  33.58 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 		 350 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.83 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  33.95 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  31.56 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  31.56 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4360  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00124658  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5129  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.47 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  27.1 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.94 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  33.43 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.96 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.34 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  29.29 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3860  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.668247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>