183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3860 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3860  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
369 aa  751    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.668247  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0813  extracellular solute-binding protein family 1  35.45 
 
 
374 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  34.58 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  34.58 
 
 
336 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
336 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  32.62 
 
 
336 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 
351 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.64 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.48 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  32.71 
 
 
349 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
345 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 
370 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3734  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  31.71 
 
 
357 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.43 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.43 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  32.31 
 
 
346 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  34.26 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
345 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
360 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.09 
 
 
356 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.85 
 
 
358 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 
348 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  28.53 
 
 
354 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
342 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
339 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  31.96 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  30.49 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  31.01 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.49 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3190  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.28 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1267  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.92 
 
 
371 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.704416 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
361 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  28.66 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  30.28 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4943  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.395223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  29.63 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.21 
 
 
341 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 
351 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
348 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
348 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  31.71 
 
 
341 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
341 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
348 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
348 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
348 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  30.91 
 
 
346 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
343 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
341 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.31 
 
 
349 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
350 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
348 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
343 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  30.61 
 
 
344 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
359 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
346 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  26.43 
 
 
360 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
352 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
348 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
366 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 
356 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
349 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  29.22 
 
 
344 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
351 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.81 
 
 
367 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4603  putative ABC transporter binding protein component  29.14 
 
 
358 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921345  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
347 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5129  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
362 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.27 
 
 
348 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.97 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.97 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  28.4 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.97 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.97 
 
 
408 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
346 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.97 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.97 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.74 
 
 
363 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>