212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0813 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0813  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
374 aa  768    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3860  extracellular solute-binding protein family 1  37.85 
 
 
369 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.668247  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
353 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 
336 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  32.21 
 
 
336 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3734  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  30.09 
 
 
357 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  30.96 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
346 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4603  putative ABC transporter binding protein component  30.79 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921345  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  28.62 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3190  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.67 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  32.26 
 
 
366 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  32.26 
 
 
366 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  29.75 
 
 
363 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
349 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  30.65 
 
 
336 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
352 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
348 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 
342 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  29.63 
 
 
363 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
343 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5469  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
361 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27299  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
343 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
339 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  27.04 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.46 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
366 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 
341 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.84 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.76 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 
351 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 
359 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
348 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 
346 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  28.32 
 
 
354 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.81 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.81 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.81 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.81 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.81 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  29.24 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  26.81 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  26.81 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
348 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.05 
 
 
348 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
352 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.98 
 
 
352 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  29.28 
 
 
341 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.47 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  26.07 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  24.63 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.7 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
345 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
351 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.04 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 
352 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5129  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.61 
 
 
348 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
344 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
344 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  25.68 
 
 
361 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4943  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
352 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.395223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
345 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
342 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
347 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.23 
 
 
342 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  27.13 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  26.42 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.23 
 
 
342 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0755  ABC transporter, binding protein  27.76 
 
 
371 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491874  normal  0.244729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>