290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3862 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 348 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  36.98 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  37.75 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.46 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  40.28 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  40.21 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  39.93 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  37.9 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  39.49 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  37.65 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3447  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 		 341 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.544625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  37.09 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.81 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.08 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  37.09 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  36.71 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  33.75 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  36.08 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2211  ABC transporter, substrate binding protein (polyamine)  34.6 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.31 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  36.08 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5129  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 362 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  33.54 
 
 		 363 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  33.92 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  34.71 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.3 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  34.45 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.93 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  34.45 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.93 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  34.45 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.52 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.93 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1032  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.93 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  36.93 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.05 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  36.93 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  34.35 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  32.36 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  34.06 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.35 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  32.7 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  31.87 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.06 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4603  putative ABC transporter binding protein component  33.14 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  31.87 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  32.53 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  32.44 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  32.7 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  32.7 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.5 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3858  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4687  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.41 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  31.87 
 
 		 344 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.08 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.08 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  31.42 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4264  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3190  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.06 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3860  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.668247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.86 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>