161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1773 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1773  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  100 
 
 
377 aa  746    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2151  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  41.13 
 
 
359 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.585166  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1739  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.72 
 
 
370 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3460  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.34 
 
 
356 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.771594  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0161  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.16 
 
 
366 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1795  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  41.16 
 
 
366 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1330  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.72 
 
 
358 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0667  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.56 
 
 
357 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.872941  hitchhiker  0.00848577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003671  probable binding protein component of ABC transporter  36.83 
 
 
357 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1883  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.61 
 
 
363 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0647342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0531  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.61 
 
 
358 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174664  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7798  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 
360 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2988  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  40.23 
 
 
368 aa  252  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1267  polyamine ABC trasnporter, periplasmic polyamine-binding protein  40.23 
 
 
371 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.704416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4201  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  34.9 
 
 
357 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2152  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 
360 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.952962  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6321  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 
356 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2372  extracellular solute-binding protein family 1  36.31 
 
 
351 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3470  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  36.83 
 
 
348 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6038  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
351 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  32.95 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0446  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
344 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0443  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.67 
 
 
344 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
343 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
344 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0594  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
343 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07850  putative binding protein component of ABC transporter  34.94 
 
 
344 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0748  putative ABC transporter binding protein subunit  32.63 
 
 
348 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07870  putative binding protein component of ABC transporter  32.63 
 
 
348 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65920  hypothetical protein  34.08 
 
 
363 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400639  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  32.01 
 
 
348 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5719  hypothetical protein  34.08 
 
 
363 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 
343 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 
347 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1786  extracellular solute-binding protein family 1  32.21 
 
 
343 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149849  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.01 
 
 
348 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  33.43 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0563  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.53 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 
346 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0746  putative ABC transporter binding protein subunit  34.29 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
348 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
348 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
348 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
348 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4322  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
350 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199771  normal  0.317385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
342 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2230  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
362 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2911  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
347 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1733  putative lipoprotein signal peptide  30.84 
 
 
346 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0848422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5124  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
347 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0612646  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 
346 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2543  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
359 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2382  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
345 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
350 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4614  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
344 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.874692  normal  0.965424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
343 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  32.67 
 
 
352 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2870  PotD/PotF family extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2819  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  32.04 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.75 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02720  hypothetical protein  32.63 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0735461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1219  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1336  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0643  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.97 
 
 
367 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.12 
 
 
349 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 
348 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
348 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  32.96 
 
 
342 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3107  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
342 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0815  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.68 
 
 
408 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1811  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.68 
 
 
374 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2362  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.68 
 
 
374 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0482  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.68 
 
 
374 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0432  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.68 
 
 
348 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2501  putative polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.68 
 
 
348 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
346 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4296  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.68 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  31.44 
 
 
338 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0467  putative spermidine/putrescine-binding protein  29.38 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7064  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
353 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1865  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00327165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.73 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4873  putative spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  31.18 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987187  normal  0.365367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
352 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
341 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
339 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
341 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1590  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2365  hypothetical protein  27.32 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3860  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.668247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>