More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8489 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 346 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  41.59 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.82 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4156  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0813  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2047  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.454223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  25.07 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3717  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  23.33 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1614  spermidine/putrescine ABC transporter substrate-binding protein  27.13 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.36 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.24 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1715  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0326  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  26.43 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4108  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.84 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6089  ABC transporter substrate binding protein (polyamine)  26.16 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.33 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0300  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4044  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.18 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.74 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4002  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0308  hypothetical protein  27.24 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0567  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.149111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  25.66 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3647  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1519  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.65 
 
 		 844 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4790  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6887  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31675  normal  0.286829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  26.71 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.89 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1275  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  25.35 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2914  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  24.52 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1468  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.18 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.18 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.52 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2932  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.9 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  25.42 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.18 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.18 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0412  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.03 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0584261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.08 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.01 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.860784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.18 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6115  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.291743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>