145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5130 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5130  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
347 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5374  extracellular solute-binding protein family 1  84.44 
 
 
346 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210042  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7603  ABC transporter substrate binding protein  84.44 
 
 
346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  32.65 
 
 
348 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1248  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
347 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3187  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.65 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2705  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  26.15 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3941  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.09 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4605  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0752  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3159  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3847  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8307  ABC transporter substrate-binding protein  26.15 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0387111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0200  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4433  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.23021  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7049  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3211  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  26.53 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  23.34 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5508  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.316325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1837  ABC transporter substrate-binding protein  23.03 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0302  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  26.05 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2702  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.1 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6543  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 
407 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0438593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0745  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.57 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2329  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708409  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3160  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  25.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1897  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179851  normal  0.425748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6496  ABC transporter substrate-binding protein  23.9 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4734  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3629  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.511421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5064  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2518  bacterial extracellular solute-binding domain protein  24.65 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8489  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504362  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3515  ABC polyamine/opine transporter, periplasmic binding protein  23.64 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4425  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6624  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
348 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  24.21 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2419  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.02 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5370  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773263  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3535  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472326  normal  0.818839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4325  spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  21.47 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0759269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0883  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4380  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2372  twin-arginine translocation pathway signal  23.33 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02286  hypothetical protein  23.86 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4789  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  24.24 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333603  hitchhiker  0.0000239278 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5999  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 
362 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281164  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.54 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  22.64 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
343 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.52 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.52 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  23.57 
 
 
365 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
348 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.36 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.11 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4308  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00256094  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.55 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4410  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.97 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3137  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
524 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.87 
 
 
366 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>