More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5813 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  86.7 
 
 		 374 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 376 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  91.78 
 
 		 377 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 376 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  85.64 
 
 		 374 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 376 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  81.28 
 
 		 374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  67.49 
 
 		 370 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  72.95 
 
 		 382 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  73.19 
 
 		 316 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  53.56 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  52.74 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.22 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.27 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.83 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.53 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  26.54 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  26.54 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.64 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.26 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  24.34 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  25.63 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.43 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  29.72 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  27.62 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3955  twin-arginine translocation pathway signal  22.71 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0345  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  21.95 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0844  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.9 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  21.6 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1208  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.29 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.21 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.92 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1704  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0323  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.68 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.01 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.73 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 342 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.73 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3635  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.248377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  24.73 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1021  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.65 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 358 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4852  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0698456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2123  hypothetical protein  23.91 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.08 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3274  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.66 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3040  ABC permidine/putrescine transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.8 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>