More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2404 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
342 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  83.64 
 
 
341 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  60.12 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  52.17 
 
 
345 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  47.25 
 
 
341 aa  324  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  44.57 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
363 aa  279  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  39.38 
 
 
359 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
354 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  38.81 
 
 
357 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.62 
 
 
360 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 
360 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
349 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
363 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
350 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  36 
 
 
360 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  34.23 
 
 
345 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  34.23 
 
 
345 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.08 
 
 
349 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0869  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein PotD  36.13 
 
 
350 aa  222  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.08 
 
 
349 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.08 
 
 
349 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.08 
 
 
349 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.08 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  34.77 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
350 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
363 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
396 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
354 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  34.2 
 
 
349 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  36.2 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  36.49 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.42 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
348 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
348 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.42 
 
 
348 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
348 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  35.42 
 
 
382 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
348 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.04 
 
 
348 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
366 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.94 
 
 
357 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
357 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
357 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  37.23 
 
 
348 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  37.23 
 
 
348 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
348 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.39 
 
 
348 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
374 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 
366 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
353 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 
349 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
365 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.92 
 
 
348 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
366 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  39.06 
 
 
355 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  32.93 
 
 
400 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  34.03 
 
 
340 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  34.86 
 
 
383 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 
370 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 
342 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 
369 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  35.95 
 
 
345 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  33.73 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  35.23 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  35.23 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  33.72 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  35.82 
 
 
371 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  35.14 
 
 
367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  35.95 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  37.12 
 
 
371 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.24 
 
 
363 aa  199  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 
368 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3360  extracellular solute-binding protein  37.09 
 
 
371 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.0114368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  38 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  38 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  35 
 
 
371 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  35.76 
 
 
357 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 
359 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  35.18 
 
 
363 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 
370 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
366 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>