More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1108 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  100 
 
 
357 aa  731    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  75.63 
 
 
355 aa  566  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0844  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  63.87 
 
 
356 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  59.33 
 
 
359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  62.15 
 
 
357 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  55.71 
 
 
357 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  56.94 
 
 
363 aa  418  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  56.42 
 
 
357 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  56.42 
 
 
357 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  55.65 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  48.88 
 
 
357 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
357 aa  348  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 
357 aa  348  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  49.16 
 
 
359 aa  334  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  45.81 
 
 
360 aa  331  9e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  45.02 
 
 
360 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 
354 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  43.18 
 
 
349 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  44.54 
 
 
350 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
374 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
374 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 
360 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  38.61 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  36.84 
 
 
340 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.79 
 
 
347 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.08 
 
 
347 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.49 
 
 
348 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 
346 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
363 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  40.92 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0869  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein PotD  38.44 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.336498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  40.37 
 
 
348 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.69 
 
 
348 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  40.37 
 
 
348 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
348 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  39.5 
 
 
345 aa  242  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.06 
 
 
348 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.06 
 
 
348 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  37.65 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  37.62 
 
 
345 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  37.35 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
349 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  37.97 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  38.05 
 
 
358 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.45 
 
 
349 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  37.42 
 
 
348 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.75 
 
 
349 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.75 
 
 
349 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.75 
 
 
349 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  36.75 
 
 
349 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  35.09 
 
 
347 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.38 
 
 
343 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  38.05 
 
 
345 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  38.05 
 
 
345 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
345 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  35.65 
 
 
342 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 
363 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
354 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 
365 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.93 
 
 
361 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  31.96 
 
 
345 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  33.33 
 
 
371 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
342 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  35.65 
 
 
367 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 
396 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
368 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
363 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  35.65 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 
401 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.76 
 
 
364 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  35.78 
 
 
366 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2802  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 
355 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 
364 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  34.46 
 
 
342 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  36.23 
 
 
365 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
341 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  31.75 
 
 
362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  36.23 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3516  putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein  32.71 
 
 
368 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
342 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 
375 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  32.34 
 
 
345 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
365 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>