More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4852 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4852  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
384 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0698456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3767  extracellular solute-binding protein  64.51 
 
 
385 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3040  ABC permidine/putrescine transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.77 
 
 
385 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2168  putative periplasmic binding ABC transporter protein  58.9 
 
 
386 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4771  extracellular solute-binding protein family 1  57.85 
 
 
386 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
366 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 
349 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.86 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
349 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
349 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.57 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
357 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.57 
 
 
349 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 
342 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 
359 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.86 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  30.79 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.82 
 
 
355 aa  163  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
363 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  30.84 
 
 
345 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
341 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  30.84 
 
 
345 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.79 
 
 
355 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
353 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
368 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  31.48 
 
 
342 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  31.8 
 
 
345 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.13 
 
 
360 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
396 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
357 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0844  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.67 
 
 
356 aa  156  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
357 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
396 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  30.69 
 
 
360 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  29.61 
 
 
357 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  30.45 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  31.21 
 
 
363 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
363 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  30.45 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 
359 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.99 
 
 
364 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
360 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4305  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
359 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.89 
 
 
363 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
364 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0873  periplasmic polyamine-binding protein, putative  29.65 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262615  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3845  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  29.3 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0903  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
359 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551806  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.45 
 
 
367 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.56 
 
 
369 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
387 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
364 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
366 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.16 
 
 
369 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
366 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.66 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
354 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 
367 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
354 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
366 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.27 
 
 
365 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
366 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
361 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
365 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 
383 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.26 
 
 
345 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.71 
 
 
361 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  29.62 
 
 
367 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
365 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
367 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
366 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
366 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
362 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  28.8 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0917  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0241526  normal  0.315569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  32.66 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  30.77 
 
 
362 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
375 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.25 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  29.23 
 
 
345 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>