More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5897 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 383 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  38.44 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.83 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  36.56 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.54 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  37.57 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  38.37 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  37.57 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.57 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  37.76 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  37.57 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  36.92 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  37.57 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  37.83 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  37.36 
 
 		 369 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  36.87 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  36.81 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  36.81 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  37.83 
 
 		 365 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  36.81 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  38.64 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  35.48 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  38.64 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  34.17 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  34.86 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.68 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4019  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 367 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  34.28 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4388  extracellular solute-binding protein family 1  34.99 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  35.5 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  34.06 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  33.99 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  36.26 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.04 
 
 		 369 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.75 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0375  extracellular solute-binding protein family 1  34.51 
 
 		 365 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00751674  decreased coverage  0.000421612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.31 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.31 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.4 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 365 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.96 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3360  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.0114368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  33.23 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.43 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 362 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.61 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.73 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.73 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>