More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4949 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 366 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  92.67 
 
 		 365 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4388  extracellular solute-binding protein family 1  75.51 
 
 		 367 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  74.86 
 
 		 375 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4019  extracellular solute-binding protein  75.51 
 
 		 367 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  73.47 
 
 		 367 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3516  putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein  56.52 
 
 		 368 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  57.73 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  58.27 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  56.35 
 
 		 367 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  56.63 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  56.36 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  58.77 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 		 367 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3360  extracellular solute-binding protein  56.45 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.0114368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  54.18 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2082  extracellular solute-binding protein  55.41 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472813  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1501  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 		 371 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2105  extracellular solute-binding protein  55.74 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1241  extracellular solute-binding protein  57.26 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0375  extracellular solute-binding protein family 1  57.02 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00751674  decreased coverage  0.000421612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  56.14 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  51.4 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  50.82 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.28 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.86 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.28 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  51.12 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.28 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  51.63 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.42 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  50.95 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00859  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2788  extracellular solute-binding protein family 1  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0926  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.42 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2742  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.602994  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2477  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.996224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00865  hypothetical protein  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.42 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0957  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1010  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50.42 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  normal  0.285031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  50 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  51.73 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1011  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.3 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1030  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.3 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0982  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.3 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  50.14 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0914  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.3 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  49.46 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0950  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.03 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  51.63 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  48.09 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.25 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  47.34 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.93 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  47.54 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.27 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  47.27 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  48.91 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  48.03 
 
 		 367 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.13 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  48.03 
 
 		 367 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  47.5 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  47.49 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2642  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  47.21 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00909614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 387 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  47.63 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  47.53 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  47.47 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  47.63 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  49.04 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  49.71 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  46.72 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  47.08 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.84 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  47.81 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 		 375 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0282  extracellular solute-binding protein  48.55 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443093  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 361 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  45.15 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  47.8 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29090  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.36 
 
 		 363 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.9 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3989  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  45.08 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  47.11 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  45.28 
 
 		 361 aa  341  9e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>