More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2913 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 363 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  42.68 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40.29 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  39.49 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40.29 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  38.7 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  38.7 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  42.15 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  41.43 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  42.72 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  38.46 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  42.61 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  38.17 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  37.68 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  37.38 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  41.39 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  36.88 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  39.83 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  38.3 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  34.08 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  35.29 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  39.2 
 
 		 342 aa  235  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  40.88 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  36.31 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  32.95 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  34.3 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  40.59 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  35.29 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  39.47 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  37.85 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4255  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000172827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  34.14 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  38.01 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.24 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  36.71 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  34.21 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  38.03 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  40.75 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  38.01 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  36.98 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.86 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0569  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.416765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2802  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0869  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein PotD  36.92 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  37.75 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 364 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 353 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.96 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  36.6 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  36.6 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  38.46 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>