More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0979 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 366 aa  755    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1531  polyamine transport protein PotD  59.52 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17610  polyamine ABC transporter  59.82 
 
 		 354 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4396  putrescine ABC transporter periplasmic putrescine-binding protein  51.21 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  37.39 
 
 		 374 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.53 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  36.29 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  35.5 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  36.74 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.57 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  35.71 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  35.71 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.03 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2377  extracellular solute-binding protein family 1  35.85 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0307958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.33 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.03 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.33 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.33 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.4 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.33 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  34.33 
 
 		 373 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  35.5 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  34.63 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.03 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.03 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  35.03 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3260  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.63 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  34.53 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.82 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  36.39 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  33.92 
 
 		 369 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.03 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  34.03 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  34.03 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  34.22 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29090  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  33.89 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.73 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.73 
 
 		 406 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  33.73 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3989  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  33.33 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3845  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  32.79 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  33.6 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  35.22 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.41 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.2 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.2 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.2 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  33.93 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>