More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1193 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 355 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  42.55 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  41.87 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  41.03 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  40.17 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  40.17 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  36.06 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  37.2 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 349 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0569  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.416765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1531  polyamine transport protein PotD  31.85 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  31.56 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17610  polyamine ABC transporter  32.14 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  31.17 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  31.27 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  30.81 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  30.81 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.89 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.41 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.19 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.19 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.19 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.19 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  32.25 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1364  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  31.93 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3719  periplasmic polyamine-binding protein, putative  32.97 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0307875  normal  0.343759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2188  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  29.13 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  30.6 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  31.62 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.34 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.33 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0375  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00751674  decreased coverage  0.000421612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  31.42 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.51 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  30.33 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  32.73 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  30.11 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.6 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  30.99 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02286  hypothetical protein  31.4 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  31.44 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.06 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  28.41 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  31.64 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4396  putrescine ABC transporter periplasmic putrescine-binding protein  29.59 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  31.09 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>