More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1330 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
349 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  54.52 
 
 
340 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  54.33 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  53.82 
 
 
374 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  53.96 
 
 
374 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
370 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  53.92 
 
 
376 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  53.92 
 
 
376 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  53.92 
 
 
376 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  53.92 
 
 
382 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  53.78 
 
 
374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  52.38 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.3 
 
 
353 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
349 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
350 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
349 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.17 
 
 
349 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.39 
 
 
349 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.81 
 
 
349 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.81 
 
 
349 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.87 
 
 
349 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.87 
 
 
349 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.87 
 
 
349 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.81 
 
 
360 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  26.95 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.1 
 
 
360 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.16 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  24.15 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0286  ABC transporter periplasmic binding protein  28.16 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02286  hypothetical protein  26.69 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.05 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.05 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
360 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3929  family 1 extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
363 aa  96.3  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 
419 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.38 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0323  twin-arginine translocation pathway signal  27.48 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  23.47 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  25.07 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2123  hypothetical protein  26.12 
 
 
372 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0659  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.51 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.717028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.64 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.93 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4758  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.76 
 
 
370 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263083  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0844  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.59 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2804  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
353 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.72 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.84 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  22.67 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.72 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.72 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  27.21 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
366 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.05 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.09 
 
 
357 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.2 
 
 
361 aa  86.3  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
358 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3274  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
375 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
366 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1021  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.62 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.09 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  25 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0185  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.69 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.74 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4852  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0698456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.4 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  23.76 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>