More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3377 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
414 aa  836    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 
405 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1949  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  40.45 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316244  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 
383 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1091  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 
383 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1032  extracellular solute-binding protein family 1  38.98 
 
 
388 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4236  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1486  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  37.6 
 
 
381 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0980554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1048  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
383 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357098  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 
386 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2187  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 
386 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227535  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3646  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 
384 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 
381 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2045  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.26 
 
 
381 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.600032  hitchhiker  0.000000000000249454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.54 
 
 
381 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000404923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 
389 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01397  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  35.26 
 
 
381 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2206  extracellular solute-binding protein family 1  35.26 
 
 
381 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.313197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1524  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.26 
 
 
381 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3723  extracellular solute-binding protein family 1  35.65 
 
 
386 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415779  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01408  hypothetical protein  35.26 
 
 
381 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1619  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.26 
 
 
381 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2219  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
381 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3423  extracellular solute-binding protein family 1  35.38 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2788  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
386 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 
383 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2444  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 
401 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512848  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
351 aa  133  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.6 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
373 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
374 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.77 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.03 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.59191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  24.91 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  23.05 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.38 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.29 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.29 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  22.83 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  20.13 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.2 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  19.34 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2095  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0550638  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2802  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2394  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.26 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  20 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.74 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.07 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.47 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 
356 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  24.14 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  23.55 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0822  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  19.2 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0853075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 
400 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  20.59 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  23.55 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  20.17 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 
354 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  20.75 
 
 
362 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 
336 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.21 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>