155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1949 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1949  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 443 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1032  extracellular solute-binding protein family 1  46.97 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  40.45 
 
 		 414 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3646  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 384 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1048  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357098  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2788  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2045  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.600032  hitchhiker  0.000000000000249454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01397  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  30.25 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2206  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.313197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1486  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  31.82 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0980554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.97 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000404923 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01408  hypothetical protein  30.25 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2219  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1524  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1619  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1091  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4236  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 389 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2187  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227535  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3723  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415779  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3423  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2444  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512848  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.54 
 
 		 353 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  28.36 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  25.81 
 
 		 364 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  22.71 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  26.13 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  25.69 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.92 
 
 		 345 aa  57  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 366 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.18 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 396 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.78 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.36 
 
 		 360 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  23.08 
 
 		 360 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.53 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4497  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25.67 
 
 		 367 aa  54.3  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 366 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.55 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  24.31 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3635  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 358 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.248377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5836  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  26.4 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 364 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 341 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3222  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.52 
 
 		 369 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.15 
 
 		 369 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4498  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 352 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.73 
 
 		 370 aa  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0950  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.8 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.82 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.77 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1011  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.8 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>