More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2417 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
386 aa  793    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  78.53 
 
 
389 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1048  extracellular solute-binding protein  67.29 
 
 
383 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357098  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4236  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 
383 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2187  extracellular solute-binding protein  65.6 
 
 
386 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227535  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  67.11 
 
 
383 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3646  extracellular solute-binding protein  65.61 
 
 
384 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1486  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  66.4 
 
 
381 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0980554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1091  extracellular solute-binding protein  66.4 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  65.32 
 
 
381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01397  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  65.16 
 
 
381 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2206  extracellular solute-binding protein family 1  65.16 
 
 
381 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.313197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1619  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.89 
 
 
381 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2045  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.89 
 
 
381 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.600032  hitchhiker  0.000000000000249454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2219  extracellular solute-binding protein  64.89 
 
 
381 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1524  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  65.16 
 
 
381 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01408  hypothetical protein  65.16 
 
 
381 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.63 
 
 
381 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000404923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3723  extracellular solute-binding protein family 1  65.69 
 
 
386 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415779  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  63.92 
 
 
402 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2788  extracellular solute-binding protein  66.05 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3423  extracellular solute-binding protein family 1  65.16 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  59.89 
 
 
383 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  42.58 
 
 
405 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2444  extracellular solute-binding protein family 1  41.79 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512848  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  36.69 
 
 
414 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1949  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  30.19 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316244  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1032  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 
388 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.97 
 
 
353 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  26.69 
 
 
373 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.36 
 
 
484 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.36 
 
 
364 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.36 
 
 
364 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.36 
 
 
356 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.4 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  25.73 
 
 
362 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.44 
 
 
391 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
342 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  27.03 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.03 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  27.03 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  25.38 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.71 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.1 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  26.1 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.68 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  26.1 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  26.1 
 
 
373 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  26.01 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 
356 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.76 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1364  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.92 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.12 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6638  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.19 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.19 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.19 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  26.64 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.59 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.89 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3847  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  26.28 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  26.32 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.75 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.26 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.83 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>