157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0104 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 379 aa  769    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  76.32 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  75.26 
 
 		 398 aa  606  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0100  extracellular solute-binding protein family 1  68.95 
 
 		 403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  35.64 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3861  hypothetical protein  33.07 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0902181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  25.67 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.52 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  25.88 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.32 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.95 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.97 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  24.29 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.14 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  23.23 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  23.33 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  22.53 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0659  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.65 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.717028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  23.17 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.47 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.06 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  29.71 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  25.65 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.38 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1819  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  21.98 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  23.39 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  25.89 
 
 		 366 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  21.96 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.16 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.28 
 
 		 844 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.55 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  25.47 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  20.07 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  22.98 
 
 		 420 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  23.08 
 
 		 345 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0185  extracellular solute-binding protein family 1  21.4 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  25 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  24.11 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2575  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.941635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>