267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0100 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0100  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 403 aa  822    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  72.61 
 
 		 398 aa  621  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  65.33 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  68.95 
 
 		 379 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  37.63 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3861  hypothetical protein  34.5 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0902181  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  26.6 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  20.9 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.46 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.86 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.86 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  22.64 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.31 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  23.31 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  24.58 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2575  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.941635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  22.43 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1819  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.04 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.22 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  22.76 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.22 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  22.91 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  25.56 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1513  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0659  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.86 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.717028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  29.21 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  21.4 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0853075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  24.26 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  20.35 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  21.02 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.33 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0086  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein, putative  22.91 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  22.18 
 
 		 364 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  22.18 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  22.18 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  22.18 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1581  putative ABC transport system, exported substrate-binding protein  23.19 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  26.09 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.8 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4755  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.8 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.56 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  19.63 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.85 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.8 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.8 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>