More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3395 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 416 aa  854    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  59.04 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  60.24 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  50.24 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  48.65 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0022  extracellular solute-binding protein  52.25 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.68503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1496  extracellular solute-binding protein family 1  33.8 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4278  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2566  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3137  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.713269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3388  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7093  extracellular solute-binding protein family 1  33.51 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3229  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.712082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0915  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  35.06 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.92 
 
 		 349 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.92 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  32.09 
 
 		 345 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  32.09 
 
 		 345 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  32.48 
 
 		 342 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.57 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.57 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.57 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  33.57 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  32.04 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 		 366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  32.42 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.38 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.99 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  29.55 
 
 		 363 aa  136  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 396 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  31.07 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.49 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  31.16 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  29.21 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  32.08 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 362 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  29.27 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  30.42 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  30.64 
 
 		 345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  28.08 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  30.1 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 360 aa  131  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  30.42 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 354 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.08 
 
 		 361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  31.97 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2188  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  28.83 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3516  putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.84 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>