More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2605 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
396 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  99.75 
 
 
396 aa  805    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3137  extracellular solute-binding protein  79.9 
 
 
393 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.713269  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2566  twin-arginine translocation pathway signal  99.75 
 
 
396 aa  805    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3388  extracellular solute-binding protein  78.37 
 
 
393 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0915  extracellular solute-binding protein family 1  37.79 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4278  extracellular solute-binding protein family 1  36.88 
 
 
389 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3229  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 
408 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.712082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1496  extracellular solute-binding protein family 1  33.92 
 
 
401 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  33.01 
 
 
412 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 
416 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  31.74 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0022  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
417 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.68503  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7093  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 
432 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 
419 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
354 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 
420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
359 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  30.8 
 
 
349 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
354 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
350 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
357 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.84 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
357 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
366 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.68 
 
 
343 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0194  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.72 
 
 
359 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
370 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
341 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
396 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
360 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.42 
 
 
357 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
383 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  27.62 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.6 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1888  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  25.6 
 
 
360 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
365 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  31.21 
 
 
371 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1188  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.59 
 
 
349 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  27.99 
 
 
348 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
364 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.91 
 
 
355 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.47 
 
 
345 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1226  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
359 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
368 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
374 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.25 
 
 
349 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  27.97 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0282  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443093  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.24 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  24.92 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  28.9 
 
 
373 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
364 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  25.85 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  25.85 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
348 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
400 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.96 
 
 
347 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.86 
 
 
364 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
348 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.59191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
348 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
348 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
348 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  27.05 
 
 
357 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  25.49 
 
 
348 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.49 
 
 
348 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
346 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  24.27 
 
 
345 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.74 
 
 
363 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 
348 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 
348 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.16 
 
 
348 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>