More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1283 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 420 aa  859    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  50.12 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  49.51 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0022  extracellular solute-binding protein  51.83 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.68503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  48.65 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  46.68 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1496  extracellular solute-binding protein family 1  33.6 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0915  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3229  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.712082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4278  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 389 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7093  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3137  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.713269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2566  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3388  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 375 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  27.22 
 
 		 340 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 362 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  32.3 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  31.9 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 362 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  31.61 
 
 		 373 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  32.12 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  29.32 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  29.04 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.82 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  26.3 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  33.57 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 368 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4019  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 367 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4388  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.75 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  31.52 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.75 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  30.75 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 366 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0569  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.416765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0633  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.4 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  27.7 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0869  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein PotD  27.85 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  34.14 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  29.23 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 364 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.51 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1241  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2082  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472813  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  31.78 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  28.48 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  28.48 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  28 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.05 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  28.21 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>