202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0106 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 397 aa  806    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  72.11 
 
 		 398 aa  609  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  76.32 
 
 		 379 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0100  extracellular solute-binding protein family 1  65.33 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  36.24 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3861  hypothetical protein  31.75 
 
 		 392 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0902181  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  26.54 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  24 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  25.53 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.36 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  24.46 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1819  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2575  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.941635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.01 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1789  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  22.97 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.34 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  21.3 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.11 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.34 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.11 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.11 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.1 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.1 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.11 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.1 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0659  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  21.95 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.717028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5897  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2188  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2779  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.65 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  23.05 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 353 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3719  periplasmic polyamine-binding protein, putative  24.57 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0307875  normal  0.343759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  20.72 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  20.72 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  22.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  19.92 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.32 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0022  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.68503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7449  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.07 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.87 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.81 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  20.06 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 340 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  21.43 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4255  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000172827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  18.79 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  26.29 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3137  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 524 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  27.03 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  23.38 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0844  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.38 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>