More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2779 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2779  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 371 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  55.49 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  55.62 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  56.85 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  56.85 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  56.85 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  54.22 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  56.85 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  55.2 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  53.68 
 
 		 373 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  55.52 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  55.52 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  55.81 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  55.98 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  55.06 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  55.36 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6638  extracellular solute-binding protein family 1  54.52 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  53.68 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  54.57 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  54.86 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 484 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  54.57 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  54.19 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  54.19 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  54 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  54 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  51.96 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  53.8 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  51.68 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  46.81 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.54 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  48.2 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  47.79 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  48.12 
 
 		 362 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  48.12 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  47.83 
 
 		 362 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 369 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  48.44 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  48.68 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  48.08 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  46.78 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  46.45 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.39 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  46.45 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  48.39 
 
 		 364 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  46.65 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2642  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  47.93 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00909614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  45.3 
 
 		 367 aa  338  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.35 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.76 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  45.14 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  47.37 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.61 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.61 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.61 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 366 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0331  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.49 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  47.38 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  46.85 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  45.33 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  45.35 
 
 		 369 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.9 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2828  extracellular solute-binding protein  46.9 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2788  extracellular solute-binding protein family 1  46.8 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2477  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.996224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1010  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  normal  0.285031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00859  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0124  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  47.06 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0957  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00865  hypothetical protein  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0926  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2742  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.8 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.602994  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2257  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.61 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>