More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1790 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  94.16 
 
 
406 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  100 
 
 
417 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  76.78 
 
 
401 aa  631  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  76.52 
 
 
401 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  74.37 
 
 
401 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  76.13 
 
 
401 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  73.86 
 
 
401 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  75.06 
 
 
409 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  73.21 
 
 
401 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  72.68 
 
 
400 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  74.53 
 
 
395 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  72.15 
 
 
400 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  70.35 
 
 
399 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  71.09 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  72.92 
 
 
399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  72.92 
 
 
397 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  66.91 
 
 
397 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  72.12 
 
 
397 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  57.63 
 
 
420 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  60.05 
 
 
413 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  59.35 
 
 
404 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  54.86 
 
 
405 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  53.79 
 
 
409 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  56.1 
 
 
412 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  55.75 
 
 
404 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  58.25 
 
 
404 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  55.67 
 
 
413 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  57.51 
 
 
406 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  59.73 
 
 
400 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  55.15 
 
 
403 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  56.88 
 
 
403 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  59.52 
 
 
401 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  57.74 
 
 
401 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  61.11 
 
 
406 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  52.59 
 
 
409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  57.87 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  56.58 
 
 
404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  56.58 
 
 
404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  54.59 
 
 
404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  54.42 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  56.32 
 
 
404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  55.31 
 
 
404 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  55.08 
 
 
405 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  56.96 
 
 
400 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3877  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  53.47 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188449  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6351  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  54.88 
 
 
403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  52.64 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  55.17 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  56.53 
 
 
400 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1850  putative ABC transporter, substrate binding protein  54.62 
 
 
402 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  55.33 
 
 
403 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  54.09 
 
 
403 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  56.35 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1473  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  53.56 
 
 
406 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267716  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  52.87 
 
 
402 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  60.53 
 
 
401 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  52.44 
 
 
415 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  56.53 
 
 
402 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  53.91 
 
 
411 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  56.58 
 
 
412 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  53.3 
 
 
409 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  56.05 
 
 
407 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  60 
 
 
401 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  54.69 
 
 
401 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.37 
 
 
396 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  53.32 
 
 
409 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  51.98 
 
 
402 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  51.98 
 
 
402 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  56.76 
 
 
405 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  53.21 
 
 
427 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  53.81 
 
 
405 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  54.18 
 
 
398 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.18 
 
 
398 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0198  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  54.18 
 
 
398 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3267  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.99 
 
 
399 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.18 
 
 
398 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.18 
 
 
398 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  56.42 
 
 
409 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  54.99 
 
 
399 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.72 
 
 
399 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56224  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0076  extracellular ligand-binding receptor  54.99 
 
 
399 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.45 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  56.17 
 
 
408 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 
402 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  54.11 
 
 
411 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  53.99 
 
 
406 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  51.72 
 
 
404 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2970  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.18 
 
 
399 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.18 
 
 
399 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.62 
 
 
403 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.18 
 
 
392 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  53.64 
 
 
398 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  55.96 
 
 
408 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  53.64 
 
 
400 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.23 
 
 
404 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  50.37 
 
 
401 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  50.12 
 
 
406 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  51.72 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  48.92 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  49.76 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>