129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0659 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  70.29 
 
 		 271 aa  339  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  65.13 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  57.98 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  49.8 
 
 		 331 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  47 
 
 		 358 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  38.94 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  37.83 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.4 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.7 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.37 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.56 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  23.23 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  21.76 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  23.08 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3798  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  24.74 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  22.28 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3850  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  24.54 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.92 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  28.78 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0825  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 683 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  24.5 
 
 		 373 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  22.17 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 413 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  21.89 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  28.04 
 
 		 692 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  21.89 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  22.86 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 1101 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  44.62 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  22.17 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  25.25 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 465 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.63 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 372 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 503 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  20.56 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.06 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.7 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  20.56 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  19.81 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  26.98 
 
 		 1001 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 		 1115 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>