More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3148 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  53 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 
258 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 
345 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 
413 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  28.7 
 
 
261 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.97 
 
 
251 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.18 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
271 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.51 
 
 
327 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
317 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 
244 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 
392 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.97 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.95 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.66 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  29.36 
 
 
275 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.73 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.32 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.13 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
281 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
387 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 
238 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.97 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  30.29 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  25.11 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  27.87 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
705 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  28.37 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  22.87 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  27.76 
 
 
479 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  26.55 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  28.24 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  26.23 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.76 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
286 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
241 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>