90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0979 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  61 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  67.66 
 
 
271 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  65.13 
 
 
250 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  44.37 
 
 
331 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  43.82 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  43.35 
 
 
371 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  39.09 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
276 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 
262 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  37.56 
 
 
259 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.82 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.34 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
245 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 
248 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.28 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.96 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 
213 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  24.88 
 
 
244 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
217 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 
220 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  25 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3850  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3798  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  26 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  22.01 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  21.74 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.37 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  21.84 
 
 
258 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 
259 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
382 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.01 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.33 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  24.29 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.63 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1004  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
1120 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  22.97 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  22.9 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  26 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2213  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 
1126 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  22.4 
 
 
337 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  21.22 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  22.17 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.38 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.86 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
360 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.04 
 
 
573 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  24.62 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.96 
 
 
1099 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  22.86 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.38 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  20.6 
 
 
299 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>