140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1004 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1004  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 338 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.88 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2967  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5876  polysaccharide deacetylase  39.88 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.61 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.87 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.87 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.87 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.87 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  25.37 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2991  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.71 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  22.45 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1384  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 199 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.62 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  26.57 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.84 
 
 		 267 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 		 371 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 258 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  25.97 
 
 		 767 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  24.85 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  21.74 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0351  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  23.15 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 542 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.01 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  22.82 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  22.99 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  21.53 
 
 		 265 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  22.54 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 263 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 242 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  22.54 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  26.67 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  21.56 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  20 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  24.71 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.61 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  21.67 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.06 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  20.87 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.61 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  27.42 
 
 		 470 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  18.97 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  23.42 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  26.49 
 
 		 300 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 227 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  21.26 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  20.1 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  22.66 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>