More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1247 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  36.12 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.65 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  35.75 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 
251 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
345 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.18 
 
 
250 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
263 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
256 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.67 
 
 
250 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
360 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
238 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
255 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
277 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
284 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.64 
 
 
244 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
368 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.64 
 
 
250 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
258 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  30.15 
 
 
319 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1004  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
338 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
522 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.67 
 
 
279 aa  92  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.82 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 
331 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
302 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  34.1 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
264 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 
321 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
382 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.14 
 
 
260 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.64 
 
 
271 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
259 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.53 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.53 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.95 
 
 
260 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
276 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 
305 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
372 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
357 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 
360 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
275 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
275 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.16 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  33.96 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  30.95 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  30.95 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.52 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.3 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.37 
 
 
254 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  30.48 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  28.24 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.77 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  30.29 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.91 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.91 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>