31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0862 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  83.57 
 
 		 286 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  63.03 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  58.06 
 
 		 276 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  52.63 
 
 		 319 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.83 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 		 371 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0825  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.23 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  21.67 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  24.08 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  21.99 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  22.84 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>