124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2847 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 358 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  54.77 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  47 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  54.27 
 
 		 271 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  43.82 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  42.74 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  40.1 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  39.06 
 
 		 259 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.79 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  27.68 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  26.74 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  26.04 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  25.51 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  26.18 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  27.53 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  23.92 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.19 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 248 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  21.61 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.26 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  21.83 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 705 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.12 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.63 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  22.89 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  22.22 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  22 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  22.84 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 503 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  25.14 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.43 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  26.42 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  22.89 
 
 		 217 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.89 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.54 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.75 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 		 244 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  25.37 
 
 		 373 aa  46.2  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  23.03 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>