More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0046 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  53 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.1 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 413 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.83 
 
 		 327 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.23 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.28 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  27.07 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  27.1 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  27.1 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.32 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  27.68 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  27.68 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 317 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 295 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 1124 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.81 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  23.2 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  27.68 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  27.1 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  28.91 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 		 1101 aa  75.1  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  34.01 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.17 
 
 		 1099 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.18 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.57 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 320 aa  72  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  25.11 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  32.65 
 
 		 1001 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  25.41 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  25.11 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>