96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1961 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 331 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  54.77 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  51.9 
 
 		 271 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  49.8 
 
 		 250 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  47.76 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  44.37 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  40.42 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 276 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  35.35 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.38 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.5 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.73 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.65 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  26.9 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2967  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 285 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.76 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  28.92 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  22.27 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  23.7 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  23.7 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  24.29 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  23.22 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.45 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  28.87 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  23.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 213 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  23.96 
 
 		 244 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  25 
 
 		 244 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  22.75 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.49 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  24.85 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.51 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 404 aa  46.2  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.84 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 542 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00160  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BH20]  24.02 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 413 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  25.81 
 
 		 275 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 284 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>