131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1064 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  61 
 
 
284 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  62.39 
 
 
271 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  57.98 
 
 
250 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  47.76 
 
 
331 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
358 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  41.33 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  39.59 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  36.04 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 
222 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
345 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.33 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3850  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3798  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
382 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.71 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.13 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.88 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 
217 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  22.73 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.24 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  23.65 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
345 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
320 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  22.9 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 
354 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  23.3 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  23.15 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  22.28 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.04 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
258 aa  52  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
503 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  23.9 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  23.16 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 
212 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 
258 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  25.14 
 
 
228 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.68 
 
 
321 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.63 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1004  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
365 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.76 
 
 
573 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.64 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.29 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  22.4 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  20.63 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  23.04 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  23.91 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.69 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.83 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  25.12 
 
 
260 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
305 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  20.18 
 
 
299 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
239 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  20.18 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 
204 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  20.18 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  20.18 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  20.26 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  20.18 
 
 
299 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  20.18 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  19.1 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>