82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0687 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0687  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.029729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0505  putative lipoprotein  72.79 
 
 
319 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0862  polysaccharide deacetylase  58.06 
 
 
262 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0989  polysaccharide deacetylase  57.48 
 
 
286 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1263  hypothetical protein  55.76 
 
 
259 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2847  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 
358 aa  141  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1064  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2850  polysaccharide deacetylase  39.2 
 
 
271 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168264  hitchhiker  0.0000000000528202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0659  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.09 
 
 
250 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1961  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
331 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0979  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
284 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3366  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.434199  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1247  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
222 aa  89.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3148  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.171512  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  22.02 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 
705 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  33.09 
 
 
365 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 
360 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  24.04 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0601  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 
345 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.56 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25.46 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  21.43 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  21.94 
 
 
250 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  23.36 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  21.89 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  22.8 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 
299 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  23.73 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  22.11 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 
299 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 
699 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.04 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  23.04 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.02 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  24.09 
 
 
299 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 
397 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.73 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.17 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  24.27 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
503 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.86 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  18.78 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0825  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.44 
 
 
573 aa  42.7  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  21.05 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0046  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.96 
 
 
368 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.3 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  20.31 
 
 
235 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
259 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 
254 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>