More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3222 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  100 
 
 		 684 aa  1319    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  35 
 
 		 940 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  32.55 
 
 		 898 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 816 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  30.93 
 
 		 930 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  27.65 
 
 		 956 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 697 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 908 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 704 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 743 aa  154  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.19 
 
 		 989 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  28.72 
 
 		 924 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  28.55 
 
 		 772 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 741 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 637 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 652 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  28.35 
 
 		 1087 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 692 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  27.06 
 
 		 891 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.2 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.85 
 
 		 325 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 661 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.93 
 
 		 290 aa  97.8  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30 
 
 		 292 aa  97.8  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 292 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  26.38 
 
 		 1302 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  29.89 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  27.91 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  28.2 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  27.2 
 
 		 290 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 381 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  30.94 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  30 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  25.75 
 
 		 633 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  26.16 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 339 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 317 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  30.94 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.58 
 
 		 646 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 293 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  29.83 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  31.03 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  28.52 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  30.83 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  25.58 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 317 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 349 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.17 
 
 		 334 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  26.59 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  25.53 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  27.42 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.8 
 
 		 950 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  25 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.22 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  25.35 
 
 		 297 aa  72  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.72 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.88 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  26.44 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  25.51 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  26.02 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  28.89 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  27.6 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  26.8 
 
 		 943 aa  70.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.65 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 415 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7509  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.83 
 
 		 580 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 291 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  25.07 
 
 		 594 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  25.07 
 
 		 594 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  22.34 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  23.94 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  28.26 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>