More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4486 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  100 
 
 		 661 aa  1253    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 924 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  40.51 
 
 		 989 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  34.84 
 
 		 1087 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  33.88 
 
 		 891 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  35.22 
 
 		 1302 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  32.41 
 
 		 898 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 772 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 704 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 816 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 743 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  29.77 
 
 		 940 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 697 aa  137  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  28.57 
 
 		 956 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 652 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 381 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 659 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.93 
 
 		 325 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 346 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  25.45 
 
 		 950 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 358 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  29.79 
 
 		 943 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  29.42 
 
 		 908 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 345 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 328 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  31.53 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.16 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.84 
 
 		 350 aa  106  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 684 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 346 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 332 aa  105  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 348 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2112  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  29.39 
 
 		 959 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.29 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  37.66 
 
 		 559 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.19 
 
 		 570 aa  102  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.19 
 
 		 570 aa  102  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 637 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 435 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 464 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 358 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.44 
 
 		 593 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 349 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 603 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29.25 
 
 		 463 aa  99.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 327 aa  99  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.41 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  31.14 
 
 		 606 aa  98.2  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.55 
 
 		 830 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 314 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 354 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 461 aa  97.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  32.74 
 
 		 599 aa  97.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  26.66 
 
 		 630 aa  96.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  25.78 
 
 		 607 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 310 aa  96.3  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 460 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 456 aa  95.9  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 318 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 459 aa  96.3  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 360 aa  96.3  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.57 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3334  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 388 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.22 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.18 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 357 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 398 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 357 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 292 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.73 
 
 		 603 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 459 aa  94.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 589 aa  94.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  30.79 
 
 		 930 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 358 aa  94.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 646 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 324 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  25.18 
 
 		 951 aa  94  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 290 aa  94  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 571 aa  94  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 292 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.62 
 
 		 646 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>