More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3859 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  100 
 
 		 924 aa  1759    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  54.89 
 
 		 989 aa  896    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  42.26 
 
 		 661 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  35.16 
 
 		 891 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 692 aa  364  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  39.14 
 
 		 559 aa  284  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  30 
 
 		 950 aa  266  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3248  ABC transporter related  33.07 
 
 		 959 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 908 aa  256  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  35.22 
 
 		 594 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.88 
 
 		 594 aa  254  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.03 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  33.97 
 
 		 593 aa  251  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  34.36 
 
 		 594 aa  250  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.48 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.48 
 
 		 570 aa  249  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  33.45 
 
 		 594 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  34.19 
 
 		 594 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.54 
 
 		 594 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  34.54 
 
 		 594 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.74 
 
 		 830 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.36 
 
 		 594 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.41 
 
 		 594 aa  245  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.21 
 
 		 594 aa  244  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.21 
 
 		 594 aa  244  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 		 594 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 		 594 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 		 594 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.27 
 
 		 594 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.36 
 
 		 594 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  32.41 
 
 		 593 aa  242  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.24 
 
 		 951 aa  241  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 594 aa  240  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  30.92 
 
 		 943 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  34.86 
 
 		 823 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.78 
 
 		 603 aa  237  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  33.39 
 
 		 594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  36.79 
 
 		 608 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7509  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 580 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  34.69 
 
 		 823 aa  235  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  29.77 
 
 		 898 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  30.33 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  33.66 
 
 		 606 aa  233  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  33.28 
 
 		 599 aa  233  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  33.28 
 
 		 590 aa  231  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 		 617 aa  231  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 611 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  32.47 
 
 		 588 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  30.33 
 
 		 940 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.12 
 
 		 597 aa  224  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  33.96 
 
 		 827 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3190  ABC transporter related  31.2 
 
 		 956 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.68 
 
 		 616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  34.66 
 
 		 589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.86 
 
 		 593 aa  221  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  33.28 
 
 		 630 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  33.45 
 
 		 604 aa  221  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  34.84 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.05 
 
 		 609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  34.81 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  30.52 
 
 		 663 aa  218  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 610 aa  217  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  35.54 
 
 		 608 aa  217  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  34.21 
 
 		 590 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.21 
 
 		 822 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  32.22 
 
 		 583 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  30.47 
 
 		 652 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  29.95 
 
 		 599 aa  215  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  34.26 
 
 		 608 aa  214  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  34.26 
 
 		 608 aa  214  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  32.8 
 
 		 832 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  34.5 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.71 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  29.82 
 
 		 652 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  31.69 
 
 		 589 aa  212  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  32.92 
 
 		 612 aa  211  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  34.39 
 
 		 589 aa  211  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  29.08 
 
 		 954 aa  210  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  32.53 
 
 		 840 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  34.63 
 
 		 1087 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  31.9 
 
 		 597 aa  209  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.5 
 
 		 852 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  30.83 
 
 		 629 aa  209  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  30.53 
 
 		 624 aa  207  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  28.5 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  34.27 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  34.57 
 
 		 608 aa  206  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  31.35 
 
 		 614 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.57 
 
 		 660 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  33.04 
 
 		 590 aa  204  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.66 
 
 		 646 aa  204  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  33.13 
 
 		 1302 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  33.57 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  28.59 
 
 		 648 aa  201  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  200  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  30.78 
 
 		 565 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  30.29 
 
 		 647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.26 
 
 		 280 aa  197  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  33.16 
 
 		 603 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>